Virkemiddelapparatet er en fellesbetegnelse som gjerne brukes på institusjoner som har fått i oppdrag fra regjeringen å forvalte ulike offentlige virkemidler, programmer og støttetiltak som skal bidra til forskning, innovasjon og næringsutvikling.
Eksempler på slike institusjoner er Norges Forskningsråd, Innovasjon Norge, SIVA, Norsk Designråd, Standard Norge og Garantiinstituttet for eksportkreditt.